幸运彩票

  天气预报: 合肥研究院主页| | | 联系我们
科学岛新闻网
科研人员利用红外光谱观测染色质重塑中DNA的B-Z构象转变
文章来源: 郑鑫鑫,张凤秋 发布时间: 2020-10-26

  近年来Z型DNA(Z-DNA)的研究引起越来越多的关注,但在细胞中对它进行观测还存在困难,主要是缺少一种简便可靠的手段可以对它进行直接观测。最近,中科院合肥研究院智能所黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作,利用红外光谱技术观测并研究了染色质重塑中DNA的B-Z构象转变,文章被Analytical Chemistry接收发表。 

  染色质重塑是表观遗传学的主要研究内容之一,它一般包括组蛋白共价修饰型或ATP(一种高能磷酸化合物)依赖型两种类型。组蛋白共价修饰型是通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝结状态;而ATP依赖型的染色质重塑是通过染色质重塑复合物来改变组蛋白与DNA的结合状态,在靠近核心组蛋白的DNA表面建立特殊构象,从而使转录因子更容易靠近DNA的过程。在染色质重塑过程中,组蛋白与DNA间的相互作用将发生变化,因此可能导致DNA构象的改变。其中,Z-DNA构象可能更利于破坏核小体的结构,在启动子处保持更为开放的染色体结构,从而促进转录。 

  为了考察细胞中染色体重塑引起的DNA构象变化,研究人员利用红外光谱技术对细胞光谱中与DNA相关的特征峰进行仔细观测与分析,发现通过调节染色质重塑复合物SWI / SNF中的催化亚基BRG1/BRM,可以诱导染色质重塑的发生,并由此诱发DNA的B-Z构象转变。红外光谱具有简便、快速、无损检测的特点,它可以对细胞中的生物大分子进行定性和定量分析。此前,黄青课题组应用红外光谱成功实现了Z-DNA的表征,发现组蛋白乙酰化可引起染色质中Z-DNA转变(Analytical Chemistry,2016, 88: 4179-4182)。在此次研究中,他们不仅利用红外光谱技术研究了ATP依赖型染色质重塑中的DNA构象转变,而且借助染色质免疫共沉淀技术,进一步验证了该染色质重塑中所发生的Z-DNA构象转变,这从另一方面也证明了红外光谱表征Z-DNA结果的可靠性。 

  以上研究得到了国家自然科学基金重点项目和青年项目的资助。 

  文章链接: 

通过傅里叶变换红外光谱法检测染色质重塑诱导Z-DNA构象

 

 

 附件: